Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6W0

BC030500, cDNA sequence BC030500 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC030500E9Q6W0 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC030500E9Q6W0 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC030500E9Q6W0 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC030500E9Q6W0 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC030500E9Q6W0 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC030500E9Q6W0 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC030500E9Q6W0 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC030500E9Q6W0 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC030500E9Q6W0 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC030500E9Q6W0 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC030500E9Q6W0 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC030500E9Q6W0 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC030500E9Q6W0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC030500E9Q6W0 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC030500E9Q6W0 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
BC030500E9Q6W0 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC030500E9Q6W0 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC030500E9Q6W0 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
BC030500E9Q6W0 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC030500E9Q6W0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC030500E9Q6W0 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC030500E9Q6W0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC030500E9Q6W0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC030500E9Q6W0 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC030500E9Q6W0 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC030500E9Q6W0 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC030500E9Q6W0 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC030500E9Q6W0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC030500E9Q6W0 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC030500E9Q6W0 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC030500E9Q6W0 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC030500E9Q6W0 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC030500E9Q6W0 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC030500E9Q6W0 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC030500E9Q6W0 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
BC030500E9Q6W0 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
BC030500E9Q6W0 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
BC030500E9Q6W0 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC030500E9Q6W0 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC030500E9Q6W0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC030500E9Q6W0 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC030500E9Q6W0 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
BC030500E9Q6W0 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC030500E9Q6W0 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC030500E9Q6W0 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC030500E9Q6W0 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC030500E9Q6W0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
BC030500E9Q6W0 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC030500E9Q6W0 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC030500E9Q6W0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
BC030500E9Q6W0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC030500E9Q6W0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC030500E9Q6W0 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC030500E9Q6W0 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC030500E9Q6W0 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
BC030500E9Q6W0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
BC030500E9Q6W0 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
BC030500E9Q6W0 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
BC030500E9Q6W0 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC13□□□□□ -0.33
BC030500E9Q6W0 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
BC030500E9Q6W0 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC030500E9Q6W0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC030500E9Q6W0 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC13□□□□□ -0.33
BC030500E9Q6W0 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC030500E9Q6W0 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC030500E9Q6W0 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC030500E9Q6W0 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC030500E9Q6W0 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BC030500E9Q6W0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BC030500E9Q6W0 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BC030500E9Q6W0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BC030500E9Q6W0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BC030500E9Q6W0 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
BC030500E9Q6W0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BC030500E9Q6W0 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
BC030500E9Q6W0 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BC030500E9Q6W0 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BC030500E9Q6W0 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BC030500E9Q6W0 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BC030500E9Q6W0 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BC030500E9Q6W0 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
BC030500E9Q6W0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BC030500E9Q6W0 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
BC030500E9Q6W0 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BC030500E9Q6W0 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
BC030500E9Q6W0 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
BC030500E9Q6W0 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
BC030500E9Q6W0 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
BC030500E9Q6W0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BC030500E9Q6W0 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BC030500E9Q6W0 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BC030500E9Q6W0 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BC030500E9Q6W0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
BC030500E9Q6W0 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BC030500E9Q6W0 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
BC030500E9Q6W0 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BC030500E9Q6W0 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
BC030500E9Q6W0 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BC030500E9Q6W0 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BC030500E9Q6W0 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms