Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E5

Srsf11, Serine/arginine-rich-splicing factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf11E9Q6E5 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Srsf11E9Q6E5 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Srsf11E9Q6E5 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Srsf11E9Q6E5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Srsf11E9Q6E5 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Srsf11E9Q6E5 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Srsf11E9Q6E5 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Srsf11E9Q6E5 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Srsf11E9Q6E5 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Srsf11E9Q6E5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Srsf11E9Q6E5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Srsf11E9Q6E5 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Srsf11E9Q6E5 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Srsf11E9Q6E5 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Srsf11E9Q6E5 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Srsf11E9Q6E5 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Srsf11E9Q6E5 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Srsf11E9Q6E5 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Srsf11E9Q6E5 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Srsf11E9Q6E5 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Srsf11E9Q6E5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Srsf11E9Q6E5 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Srsf11E9Q6E5 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Srsf11E9Q6E5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Srsf11E9Q6E5 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Srsf11E9Q6E5 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Srsf11E9Q6E5 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Srsf11E9Q6E5 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Srsf11E9Q6E5 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Srsf11E9Q6E5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Srsf11E9Q6E5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Srsf11E9Q6E5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Srsf11E9Q6E5 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Srsf11E9Q6E5 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Srsf11E9Q6E5 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Srsf11E9Q6E5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Srsf11E9Q6E5 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srsf11E9Q6E5 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srsf11E9Q6E5 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srsf11E9Q6E5 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srsf11E9Q6E5 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srsf11E9Q6E5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srsf11E9Q6E5 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srsf11E9Q6E5 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srsf11E9Q6E5 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srsf11E9Q6E5 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srsf11E9Q6E5 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srsf11E9Q6E5 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Srsf11E9Q6E5 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Srsf11E9Q6E5 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srsf11E9Q6E5 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Srsf11E9Q6E5 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srsf11E9Q6E5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srsf11E9Q6E5 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srsf11E9Q6E5 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srsf11E9Q6E5 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srsf11E9Q6E5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srsf11E9Q6E5 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srsf11E9Q6E5 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srsf11E9Q6E5 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srsf11E9Q6E5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srsf11E9Q6E5 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srsf11E9Q6E5 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Srsf11E9Q6E5 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Srsf11E9Q6E5 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Srsf11E9Q6E5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Srsf11E9Q6E5 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Srsf11E9Q6E5 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Srsf11E9Q6E5 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Srsf11E9Q6E5 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Srsf11E9Q6E5 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Srsf11E9Q6E5 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Srsf11E9Q6E5 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Srsf11E9Q6E5 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Srsf11E9Q6E5 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Srsf11E9Q6E5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Srsf11E9Q6E5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Srsf11E9Q6E5 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Srsf11E9Q6E5 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Srsf11E9Q6E5 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Srsf11E9Q6E5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Srsf11E9Q6E5 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Srsf11E9Q6E5 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Srsf11E9Q6E5 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Srsf11E9Q6E5 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Srsf11E9Q6E5 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Srsf11E9Q6E5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Srsf11E9Q6E5 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Srsf11E9Q6E5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Srsf11E9Q6E5 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Srsf11E9Q6E5 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Srsf11E9Q6E5 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Srsf11E9Q6E5 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Srsf11E9Q6E5 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Srsf11E9Q6E5 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Srsf11E9Q6E5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Srsf11E9Q6E5 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Srsf11E9Q6E5 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Srsf11E9Q6E5 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Srsf11E9Q6E5 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms