Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6D3

Ccdc121, Coiled-coil domain-containing 121, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc121E9Q6D3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc121E9Q6D3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc121E9Q6D3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc121E9Q6D3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc121E9Q6D3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc121E9Q6D3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc121E9Q6D3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc121E9Q6D3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc121E9Q6D3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc121E9Q6D3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc121E9Q6D3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc121E9Q6D3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc121E9Q6D3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc121E9Q6D3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc121E9Q6D3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc121E9Q6D3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc121E9Q6D3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc121E9Q6D3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc121E9Q6D3 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc121E9Q6D3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc121E9Q6D3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc121E9Q6D3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc121E9Q6D3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc121E9Q6D3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc121E9Q6D3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc121E9Q6D3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc121E9Q6D3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc121E9Q6D3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc121E9Q6D3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc121E9Q6D3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc121E9Q6D3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc121E9Q6D3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc121E9Q6D3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc121E9Q6D3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc121E9Q6D3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc121E9Q6D3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc121E9Q6D3 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc121E9Q6D3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc121E9Q6D3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc121E9Q6D3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc121E9Q6D3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc121E9Q6D3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc121E9Q6D3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc121E9Q6D3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc121E9Q6D3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc121E9Q6D3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc121E9Q6D3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc121E9Q6D3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc121E9Q6D3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc121E9Q6D3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc121E9Q6D3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc121E9Q6D3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc121E9Q6D3 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc121E9Q6D3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc121E9Q6D3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc121E9Q6D3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc121E9Q6D3 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc121E9Q6D3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc121E9Q6D3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc121E9Q6D3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc121E9Q6D3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc121E9Q6D3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc121E9Q6D3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc121E9Q6D3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc121E9Q6D3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc121E9Q6D3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc121E9Q6D3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc121E9Q6D3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc121E9Q6D3 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc121E9Q6D3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc121E9Q6D3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc121E9Q6D3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc121E9Q6D3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc121E9Q6D3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc121E9Q6D3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc121E9Q6D3 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc121E9Q6D3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc121E9Q6D3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc121E9Q6D3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc121E9Q6D3 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc121E9Q6D3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc121E9Q6D3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc121E9Q6D3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc121E9Q6D3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc121E9Q6D3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc121E9Q6D3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc121E9Q6D3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc121E9Q6D3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc121E9Q6D3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc121E9Q6D3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc121E9Q6D3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc121E9Q6D3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc121E9Q6D3 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc121E9Q6D3 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc121E9Q6D3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc121E9Q6D3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc121E9Q6D3 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc121E9Q6D3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc121E9Q6D3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc121E9Q6D3 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms