Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20518E9Q548 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20518E9Q548 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20518E9Q548 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20518E9Q548 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20518E9Q548 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20518E9Q548 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm20518E9Q548 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20518E9Q548 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20518E9Q548 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20518E9Q548 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20518E9Q548 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20518E9Q548 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20518E9Q548 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20518E9Q548 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20518E9Q548 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20518E9Q548 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20518E9Q548 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20518E9Q548 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20518E9Q548 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20518E9Q548 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20518E9Q548 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20518E9Q548 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20518E9Q548 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20518E9Q548 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20518E9Q548 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20518E9Q548 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20518E9Q548 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20518E9Q548 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20518E9Q548 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20518E9Q548 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm20518E9Q548 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20518E9Q548 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm20518E9Q548 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20518E9Q548 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20518E9Q548 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20518E9Q548 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20518E9Q548 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20518E9Q548 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20518E9Q548 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20518E9Q548 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20518E9Q548 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20518E9Q548 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20518E9Q548 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20518E9Q548 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20518E9Q548 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20518E9Q548 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20518E9Q548 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20518E9Q548 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20518E9Q548 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20518E9Q548 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20518E9Q548 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20518E9Q548 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20518E9Q548 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20518E9Q548 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20518E9Q548 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20518E9Q548 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20518E9Q548 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20518E9Q548 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20518E9Q548 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20518E9Q548 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20518E9Q548 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20518E9Q548 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20518E9Q548 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20518E9Q548 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20518E9Q548 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20518E9Q548 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20518E9Q548 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20518E9Q548 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20518E9Q548 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20518E9Q548 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20518E9Q548 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20518E9Q548 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20518E9Q548 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20518E9Q548 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20518E9Q548 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm20518E9Q548 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm20518E9Q548 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm20518E9Q548 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm20518E9Q548 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm20518E9Q548 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm20518E9Q548 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm20518E9Q548 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm20518E9Q548 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm20518E9Q548 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm20518E9Q548 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm20518E9Q548 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20518E9Q548 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20518E9Q548 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20518E9Q548 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm20518E9Q548 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20518E9Q548 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms