Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
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