Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC4.43□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC4.43□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC4.43□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC4.42□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
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