Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Zfp558E9Q1J0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp558E9Q1J0 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp558E9Q1J0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp558E9Q1J0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp558E9Q1J0 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp558E9Q1J0 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp558E9Q1J0 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp558E9Q1J0 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Zfp558E9Q1J0 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp558E9Q1J0 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp558E9Q1J0 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp558E9Q1J0 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Zfp558E9Q1J0 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp558E9Q1J0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp558E9Q1J0 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp558E9Q1J0 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp558E9Q1J0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp558E9Q1J0 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Zfp558E9Q1J0 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp558E9Q1J0 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp558E9Q1J0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp558E9Q1J0 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp558E9Q1J0 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Zfp558E9Q1J0 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp558E9Q1J0 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Zfp558E9Q1J0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Zfp558E9Q1J0 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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Zfp558E9Q1J0 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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Zfp558E9Q1J0 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zfp558E9Q1J0 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zfp558E9Q1J0 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Zfp558E9Q1J0 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zfp558E9Q1J0 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zfp558E9Q1J0 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zfp558E9Q1J0 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Zfp558E9Q1J0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zfp558E9Q1J0 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zfp558E9Q1J0 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zfp558E9Q1J0 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Zfp558E9Q1J0 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zfp558E9Q1J0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zfp558E9Q1J0 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zfp558E9Q1J0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zfp558E9Q1J0 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zfp558E9Q1J0 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zfp558E9Q1J0 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zfp558E9Q1J0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zfp558E9Q1J0 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zfp558E9Q1J0 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zfp558E9Q1J0 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zfp558E9Q1J0 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zfp558E9Q1J0 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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