Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Myo5cE9Q1F5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Myo5cE9Q1F5 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Myo5cE9Q1F5 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Myo5cE9Q1F5 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Myo5cE9Q1F5 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Myo5cE9Q1F5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Myo5cE9Q1F5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Myo5cE9Q1F5 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Myo5cE9Q1F5 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Myo5cE9Q1F5 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Myo5cE9Q1F5 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Myo5cE9Q1F5 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Myo5cE9Q1F5 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Myo5cE9Q1F5 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Myo5cE9Q1F5 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Myo5cE9Q1F5 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Myo5cE9Q1F5 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Myo5cE9Q1F5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Myo5cE9Q1F5 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Myo5cE9Q1F5 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Myo5cE9Q1F5 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Myo5cE9Q1F5 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Myo5cE9Q1F5 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Myo5cE9Q1F5 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Myo5cE9Q1F5 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Myo5cE9Q1F5 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Myo5cE9Q1F5 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Myo5cE9Q1F5 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Myo5cE9Q1F5 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Myo5cE9Q1F5 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Myo5cE9Q1F5 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Myo5cE9Q1F5 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Myo5cE9Q1F5 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Myo5cE9Q1F5 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Myo5cE9Q1F5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Myo5cE9Q1F5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Myo5cE9Q1F5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Myo5cE9Q1F5 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Myo5cE9Q1F5 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Myo5cE9Q1F5 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Myo5cE9Q1F5 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Myo5cE9Q1F5 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Myo5cE9Q1F5 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Myo5cE9Q1F5 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Myo5cE9Q1F5 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Myo5cE9Q1F5 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Myo5cE9Q1F5 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Myo5cE9Q1F5 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Myo5cE9Q1F5 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Myo5cE9Q1F5 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Myo5cE9Q1F5 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Myo5cE9Q1F5 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Myo5cE9Q1F5 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Myo5cE9Q1F5 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Myo5cE9Q1F5 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Myo5cE9Q1F5 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Myo5cE9Q1F5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Myo5cE9Q1F5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Myo5cE9Q1F5 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Myo5cE9Q1F5 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Myo5cE9Q1F5 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Myo5cE9Q1F5 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Myo5cE9Q1F5 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Myo5cE9Q1F5 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Myo5cE9Q1F5 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Myo5cE9Q1F5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Myo5cE9Q1F5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Myo5cE9Q1F5 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms