Protein–RNA interactions for Protein: E9Q166

Atad2b, ATPase family, AAA domain-containing 2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad2bE9Q166 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Atad2bE9Q166 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Atad2bE9Q166 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Atad2bE9Q166 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Atad2bE9Q166 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Atad2bE9Q166 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Atad2bE9Q166 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Atad2bE9Q166 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Atad2bE9Q166 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Atad2bE9Q166 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Atad2bE9Q166 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Atad2bE9Q166 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Atad2bE9Q166 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Atad2bE9Q166 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Atad2bE9Q166 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Atad2bE9Q166 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Atad2bE9Q166 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Atad2bE9Q166 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Atad2bE9Q166 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Atad2bE9Q166 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Atad2bE9Q166 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Atad2bE9Q166 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Atad2bE9Q166 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Atad2bE9Q166 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Atad2bE9Q166 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Atad2bE9Q166 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Atad2bE9Q166 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Atad2bE9Q166 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Atad2bE9Q166 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Atad2bE9Q166 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Atad2bE9Q166 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Atad2bE9Q166 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Atad2bE9Q166 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Atad2bE9Q166 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Atad2bE9Q166 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Atad2bE9Q166 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Atad2bE9Q166 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Atad2bE9Q166 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Atad2bE9Q166 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Atad2bE9Q166 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Atad2bE9Q166 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Atad2bE9Q166 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Atad2bE9Q166 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Atad2bE9Q166 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Atad2bE9Q166 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Atad2bE9Q166 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Atad2bE9Q166 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Atad2bE9Q166 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Atad2bE9Q166 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Atad2bE9Q166 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Atad2bE9Q166 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Atad2bE9Q166 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Atad2bE9Q166 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Atad2bE9Q166 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Atad2bE9Q166 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Atad2bE9Q166 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Atad2bE9Q166 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Atad2bE9Q166 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Atad2bE9Q166 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Atad2bE9Q166 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Atad2bE9Q166 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Atad2bE9Q166 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Atad2bE9Q166 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Atad2bE9Q166 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Atad2bE9Q166 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Atad2bE9Q166 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Atad2bE9Q166 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Atad2bE9Q166 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Atad2bE9Q166 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Atad2bE9Q166 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Atad2bE9Q166 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Atad2bE9Q166 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Atad2bE9Q166 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Atad2bE9Q166 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Atad2bE9Q166 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Atad2bE9Q166 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Atad2bE9Q166 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Atad2bE9Q166 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Atad2bE9Q166 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Atad2bE9Q166 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Atad2bE9Q166 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Atad2bE9Q166 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Atad2bE9Q166 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Atad2bE9Q166 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Atad2bE9Q166 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Atad2bE9Q166 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Atad2bE9Q166 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Atad2bE9Q166 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Atad2bE9Q166 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Atad2bE9Q166 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Atad2bE9Q166 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Atad2bE9Q166 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Atad2bE9Q166 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Atad2bE9Q166 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Atad2bE9Q166 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Atad2bE9Q166 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Atad2bE9Q166 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Atad2bE9Q166 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Atad2bE9Q166 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Atad2bE9Q166 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms