Protein–RNA interactions for Protein: E9Q058

Gm3095, Predicted gene 3095, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3095E9Q058 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms