Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM4

Chd2, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd2E9PZM4 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Chd2E9PZM4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chd2E9PZM4 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chd2E9PZM4 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chd2E9PZM4 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chd2E9PZM4 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chd2E9PZM4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chd2E9PZM4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chd2E9PZM4 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chd2E9PZM4 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chd2E9PZM4 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chd2E9PZM4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chd2E9PZM4 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chd2E9PZM4 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chd2E9PZM4 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Chd2E9PZM4 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Chd2E9PZM4 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chd2E9PZM4 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chd2E9PZM4 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chd2E9PZM4 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Chd2E9PZM4 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chd2E9PZM4 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chd2E9PZM4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Chd2E9PZM4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Chd2E9PZM4 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chd2E9PZM4 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chd2E9PZM4 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chd2E9PZM4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chd2E9PZM4 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Chd2E9PZM4 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chd2E9PZM4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chd2E9PZM4 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chd2E9PZM4 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chd2E9PZM4 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Chd2E9PZM4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chd2E9PZM4 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chd2E9PZM4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chd2E9PZM4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chd2E9PZM4 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chd2E9PZM4 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chd2E9PZM4 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chd2E9PZM4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chd2E9PZM4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chd2E9PZM4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chd2E9PZM4 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chd2E9PZM4 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chd2E9PZM4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chd2E9PZM4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chd2E9PZM4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chd2E9PZM4 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chd2E9PZM4 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chd2E9PZM4 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chd2E9PZM4 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chd2E9PZM4 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chd2E9PZM4 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chd2E9PZM4 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chd2E9PZM4 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chd2E9PZM4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chd2E9PZM4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chd2E9PZM4 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chd2E9PZM4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chd2E9PZM4 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chd2E9PZM4 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chd2E9PZM4 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chd2E9PZM4 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chd2E9PZM4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chd2E9PZM4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chd2E9PZM4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chd2E9PZM4 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Chd2E9PZM4 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chd2E9PZM4 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chd2E9PZM4 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chd2E9PZM4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chd2E9PZM4 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chd2E9PZM4 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Chd2E9PZM4 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Chd2E9PZM4 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chd2E9PZM4 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Chd2E9PZM4 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chd2E9PZM4 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chd2E9PZM4 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chd2E9PZM4 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chd2E9PZM4 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chd2E9PZM4 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chd2E9PZM4 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chd2E9PZM4 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Chd2E9PZM4 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chd2E9PZM4 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chd2E9PZM4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chd2E9PZM4 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chd2E9PZM4 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chd2E9PZM4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chd2E9PZM4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chd2E9PZM4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chd2E9PZM4 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chd2E9PZM4 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chd2E9PZM4 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chd2E9PZM4 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chd2E9PZM4 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chd2E9PZM4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms