Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms