Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms