Protein–RNA interactions for Protein: E9PXX9

Slc28a1, Sodium/nucleoside cotransporter, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a1E9PXX9 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms