Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms