Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms