Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms