Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ16

Klhl3, Kelch-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl3E0CZ16 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms