Protein–RNA interactions for Protein: D6MZJ6

Smpd5, MCG22096, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd5D6MZJ6 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smpd5D6MZJ6 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smpd5D6MZJ6 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smpd5D6MZJ6 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smpd5D6MZJ6 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smpd5D6MZJ6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smpd5D6MZJ6 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smpd5D6MZJ6 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smpd5D6MZJ6 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smpd5D6MZJ6 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smpd5D6MZJ6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smpd5D6MZJ6 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smpd5D6MZJ6 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smpd5D6MZJ6 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smpd5D6MZJ6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smpd5D6MZJ6 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smpd5D6MZJ6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smpd5D6MZJ6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smpd5D6MZJ6 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smpd5D6MZJ6 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smpd5D6MZJ6 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smpd5D6MZJ6 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smpd5D6MZJ6 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smpd5D6MZJ6 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Smpd5D6MZJ6 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smpd5D6MZJ6 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smpd5D6MZJ6 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smpd5D6MZJ6 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smpd5D6MZJ6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smpd5D6MZJ6 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smpd5D6MZJ6 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smpd5D6MZJ6 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smpd5D6MZJ6 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smpd5D6MZJ6 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smpd5D6MZJ6 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smpd5D6MZJ6 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smpd5D6MZJ6 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smpd5D6MZJ6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smpd5D6MZJ6 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smpd5D6MZJ6 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smpd5D6MZJ6 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smpd5D6MZJ6 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smpd5D6MZJ6 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smpd5D6MZJ6 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smpd5D6MZJ6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smpd5D6MZJ6 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smpd5D6MZJ6 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smpd5D6MZJ6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Smpd5D6MZJ6 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Smpd5D6MZJ6 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smpd5D6MZJ6 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smpd5D6MZJ6 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smpd5D6MZJ6 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smpd5D6MZJ6 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smpd5D6MZJ6 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smpd5D6MZJ6 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smpd5D6MZJ6 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Smpd5D6MZJ6 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smpd5D6MZJ6 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smpd5D6MZJ6 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smpd5D6MZJ6 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smpd5D6MZJ6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smpd5D6MZJ6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smpd5D6MZJ6 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smpd5D6MZJ6 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smpd5D6MZJ6 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpd5D6MZJ6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpd5D6MZJ6 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpd5D6MZJ6 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpd5D6MZJ6 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpd5D6MZJ6 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpd5D6MZJ6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpd5D6MZJ6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpd5D6MZJ6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpd5D6MZJ6 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpd5D6MZJ6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpd5D6MZJ6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpd5D6MZJ6 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpd5D6MZJ6 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpd5D6MZJ6 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpd5D6MZJ6 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpd5D6MZJ6 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpd5D6MZJ6 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpd5D6MZJ6 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpd5D6MZJ6 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpd5D6MZJ6 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpd5D6MZJ6 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd5D6MZJ6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd5D6MZJ6 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd5D6MZJ6 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd5D6MZJ6 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd5D6MZJ6 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd5D6MZJ6 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd5D6MZJ6 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd5D6MZJ6 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd5D6MZJ6 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd5D6MZJ6 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd5D6MZJ6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd5D6MZJ6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd5D6MZJ6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms