Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6W3

Rdh8, Retinol dehydrogenase 8, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh8D3Z6W3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rdh8D3Z6W3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rdh8D3Z6W3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rdh8D3Z6W3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rdh8D3Z6W3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rdh8D3Z6W3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rdh8D3Z6W3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rdh8D3Z6W3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rdh8D3Z6W3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rdh8D3Z6W3 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rdh8D3Z6W3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rdh8D3Z6W3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rdh8D3Z6W3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rdh8D3Z6W3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rdh8D3Z6W3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rdh8D3Z6W3 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rdh8D3Z6W3 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rdh8D3Z6W3 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rdh8D3Z6W3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rdh8D3Z6W3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rdh8D3Z6W3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rdh8D3Z6W3 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rdh8D3Z6W3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rdh8D3Z6W3 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rdh8D3Z6W3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rdh8D3Z6W3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rdh8D3Z6W3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rdh8D3Z6W3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rdh8D3Z6W3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rdh8D3Z6W3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rdh8D3Z6W3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rdh8D3Z6W3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rdh8D3Z6W3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rdh8D3Z6W3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rdh8D3Z6W3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rdh8D3Z6W3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rdh8D3Z6W3 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rdh8D3Z6W3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rdh8D3Z6W3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rdh8D3Z6W3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rdh8D3Z6W3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rdh8D3Z6W3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rdh8D3Z6W3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rdh8D3Z6W3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rdh8D3Z6W3 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rdh8D3Z6W3 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rdh8D3Z6W3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rdh8D3Z6W3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rdh8D3Z6W3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rdh8D3Z6W3 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rdh8D3Z6W3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rdh8D3Z6W3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rdh8D3Z6W3 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rdh8D3Z6W3 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rdh8D3Z6W3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rdh8D3Z6W3 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rdh8D3Z6W3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rdh8D3Z6W3 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rdh8D3Z6W3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rdh8D3Z6W3 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rdh8D3Z6W3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rdh8D3Z6W3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rdh8D3Z6W3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rdh8D3Z6W3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rdh8D3Z6W3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rdh8D3Z6W3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rdh8D3Z6W3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rdh8D3Z6W3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rdh8D3Z6W3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rdh8D3Z6W3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rdh8D3Z6W3 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rdh8D3Z6W3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rdh8D3Z6W3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rdh8D3Z6W3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rdh8D3Z6W3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rdh8D3Z6W3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rdh8D3Z6W3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rdh8D3Z6W3 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rdh8D3Z6W3 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rdh8D3Z6W3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rdh8D3Z6W3 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rdh8D3Z6W3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rdh8D3Z6W3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rdh8D3Z6W3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Rdh8D3Z6W3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rdh8D3Z6W3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rdh8D3Z6W3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Rdh8D3Z6W3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms