Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ2

Tgfbr3l, Transforming growth factor, beta receptor III-like, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr3lD3YZZ2 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgfbr3lD3YZZ2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgfbr3lD3YZZ2 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgfbr3lD3YZZ2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgfbr3lD3YZZ2 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms