Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms