Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Samd1D3YXK1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Samd1D3YXK1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Samd1D3YXK1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Samd1D3YXK1 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Samd1D3YXK1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Samd1D3YXK1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Samd1D3YXK1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Samd1D3YXK1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Samd1D3YXK1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Samd1D3YXK1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Samd1D3YXK1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Samd1D3YXK1 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Samd1D3YXK1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Samd1D3YXK1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Samd1D3YXK1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Samd1D3YXK1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Samd1D3YXK1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Samd1D3YXK1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Samd1D3YXK1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Samd1D3YXK1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Samd1D3YXK1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Samd1D3YXK1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Samd1D3YXK1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Samd1D3YXK1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Samd1D3YXK1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Samd1D3YXK1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Samd1D3YXK1 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Samd1D3YXK1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Samd1D3YXK1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Samd1D3YXK1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Samd1D3YXK1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Samd1D3YXK1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Samd1D3YXK1 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Samd1D3YXK1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Samd1D3YXK1 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Samd1D3YXK1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Samd1D3YXK1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Samd1D3YXK1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Samd1D3YXK1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Samd1D3YXK1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Samd1D3YXK1 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms