Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm17333C6EQI3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm17333C6EQI3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm17333C6EQI3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm17333C6EQI3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm17333C6EQI3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm17333C6EQI3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm17333C6EQI3 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm17333C6EQI3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm17333C6EQI3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm17333C6EQI3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm17333C6EQI3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms