Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms