Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ80

Pdzd8, PDZ domain-containing protein 8, mousemouse

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Length 1,147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd8B9EJ80 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
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Pdzd8B9EJ80 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
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Pdzd8B9EJ80 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Pdzd8B9EJ80 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Pdzd8B9EJ80 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Pdzd8B9EJ80 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Pdzd8B9EJ80 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms