Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms