Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms