Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Cfap58B2RW38 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Cfap58B2RW38 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Cfap58B2RW38 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cfap58B2RW38 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cfap58B2RW38 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cfap58B2RW38 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cfap58B2RW38 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cfap58B2RW38 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Cfap58B2RW38 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cfap58B2RW38 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cfap58B2RW38 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cfap58B2RW38 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms