Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Abcc8B2RUS7 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Abcc8B2RUS7 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Abcc8B2RUS7 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Abcc8B2RUS7 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Abcc8B2RUS7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Abcc8B2RUS7 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Abcc8B2RUS7 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Abcc8B2RUS7 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Abcc8B2RUS7 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Abcc8B2RUS7 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
Abcc8B2RUS7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Abcc8B2RUS7 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Abcc8B2RUS7 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Abcc8B2RUS7 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Abcc8B2RUS7 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Abcc8B2RUS7 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Abcc8B2RUS7 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Abcc8B2RUS7 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Abcc8B2RUS7 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Abcc8B2RUS7 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Abcc8B2RUS7 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Abcc8B2RUS7 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Abcc8B2RUS7 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Abcc8B2RUS7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Abcc8B2RUS7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Abcc8B2RUS7 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
Abcc8B2RUS7 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
Abcc8B2RUS7 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Abcc8B2RUS7 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Abcc8B2RUS7 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
Abcc8B2RUS7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Abcc8B2RUS7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Abcc8B2RUS7 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
Abcc8B2RUS7 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC32.76■■■□□ 2.84
Abcc8B2RUS7 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.84
Abcc8B2RUS7 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC32.76■■■□□ 2.84
Abcc8B2RUS7 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Abcc8B2RUS7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Abcc8B2RUS7 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Abcc8B2RUS7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Abcc8B2RUS7 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Abcc8B2RUS7 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Abcc8B2RUS7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Abcc8B2RUS7 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Abcc8B2RUS7 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Abcc8B2RUS7 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
Abcc8B2RUS7 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Abcc8B2RUS7 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Abcc8B2RUS7 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Abcc8B2RUS7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Abcc8B2RUS7 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Abcc8B2RUS7 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Abcc8B2RUS7 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Abcc8B2RUS7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Abcc8B2RUS7 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Abcc8B2RUS7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Abcc8B2RUS7 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Abcc8B2RUS7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Abcc8B2RUS7 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Abcc8B2RUS7 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Abcc8B2RUS7 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
Abcc8B2RUS7 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
Abcc8B2RUS7 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Abcc8B2RUS7 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Abcc8B2RUS7 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Abcc8B2RUS7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Abcc8B2RUS7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Abcc8B2RUS7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Abcc8B2RUS7 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Abcc8B2RUS7 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Abcc8B2RUS7 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Abcc8B2RUS7 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Abcc8B2RUS7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Abcc8B2RUS7 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Abcc8B2RUS7 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Abcc8B2RUS7 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
Abcc8B2RUS7 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Abcc8B2RUS7 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Abcc8B2RUS7 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Abcc8B2RUS7 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Abcc8B2RUS7 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Abcc8B2RUS7 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Abcc8B2RUS7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Abcc8B2RUS7 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Abcc8B2RUS7 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Abcc8B2RUS7 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Abcc8B2RUS7 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Abcc8B2RUS7 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Abcc8B2RUS7 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Abcc8B2RUS7 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Abcc8B2RUS7 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Abcc8B2RUS7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Abcc8B2RUS7 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Abcc8B2RUS7 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Abcc8B2RUS7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Abcc8B2RUS7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Abcc8B2RUS7 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Abcc8B2RUS7 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Abcc8B2RUS7 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms