Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms