Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms