Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms