Protein–RNA interactions for Protein: B1B0V2

AU022751, Expressed sequence AU022751, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU022751B1B0V2 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AU022751B1B0V2 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AU022751B1B0V2 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AU022751B1B0V2 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AU022751B1B0V2 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AU022751B1B0V2 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AU022751B1B0V2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AU022751B1B0V2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AU022751B1B0V2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AU022751B1B0V2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AU022751B1B0V2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AU022751B1B0V2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AU022751B1B0V2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AU022751B1B0V2 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AU022751B1B0V2 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AU022751B1B0V2 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AU022751B1B0V2 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AU022751B1B0V2 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
AU022751B1B0V2 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AU022751B1B0V2 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AU022751B1B0V2 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AU022751B1B0V2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AU022751B1B0V2 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AU022751B1B0V2 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AU022751B1B0V2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AU022751B1B0V2 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AU022751B1B0V2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AU022751B1B0V2 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AU022751B1B0V2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AU022751B1B0V2 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AU022751B1B0V2 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AU022751B1B0V2 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AU022751B1B0V2 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AU022751B1B0V2 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
AU022751B1B0V2 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AU022751B1B0V2 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AU022751B1B0V2 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AU022751B1B0V2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AU022751B1B0V2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AU022751B1B0V2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AU022751B1B0V2 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AU022751B1B0V2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AU022751B1B0V2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AU022751B1B0V2 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AU022751B1B0V2 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AU022751B1B0V2 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AU022751B1B0V2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AU022751B1B0V2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AU022751B1B0V2 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AU022751B1B0V2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AU022751B1B0V2 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AU022751B1B0V2 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AU022751B1B0V2 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
AU022751B1B0V2 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AU022751B1B0V2 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AU022751B1B0V2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AU022751B1B0V2 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AU022751B1B0V2 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AU022751B1B0V2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AU022751B1B0V2 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
AU022751B1B0V2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
AU022751B1B0V2 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AU022751B1B0V2 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AU022751B1B0V2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AU022751B1B0V2 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AU022751B1B0V2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AU022751B1B0V2 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AU022751B1B0V2 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AU022751B1B0V2 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AU022751B1B0V2 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AU022751B1B0V2 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AU022751B1B0V2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AU022751B1B0V2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AU022751B1B0V2 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AU022751B1B0V2 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AU022751B1B0V2 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AU022751B1B0V2 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AU022751B1B0V2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AU022751B1B0V2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AU022751B1B0V2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AU022751B1B0V2 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AU022751B1B0V2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AU022751B1B0V2 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AU022751B1B0V2 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AU022751B1B0V2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AU022751B1B0V2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AU022751B1B0V2 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AU022751B1B0V2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AU022751B1B0V2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AU022751B1B0V2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AU022751B1B0V2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AU022751B1B0V2 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AU022751B1B0V2 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AU022751B1B0V2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AU022751B1B0V2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AU022751B1B0V2 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AU022751B1B0V2 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AU022751B1B0V2 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AU022751B1B0V2 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
AU022751B1B0V2 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms