Protein–RNA interactions for Protein: B1AYM9

CK137956, cDNA sequence CK137956, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CK137956B1AYM9 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms