Protein–RNA interactions for Protein: A6NAS3

Gm3173, Alpha6-takusan, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3173A6NAS3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3173A6NAS3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3173A6NAS3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3173A6NAS3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3173A6NAS3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3173A6NAS3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3173A6NAS3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3173A6NAS3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3173A6NAS3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3173A6NAS3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3173A6NAS3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3173A6NAS3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3173A6NAS3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3173A6NAS3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3173A6NAS3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3173A6NAS3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3173A6NAS3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3173A6NAS3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3173A6NAS3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3173A6NAS3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3173A6NAS3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3173A6NAS3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3173A6NAS3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3173A6NAS3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3173A6NAS3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3173A6NAS3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3173A6NAS3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3173A6NAS3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3173A6NAS3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3173A6NAS3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3173A6NAS3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3173A6NAS3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3173A6NAS3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3173A6NAS3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3173A6NAS3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3173A6NAS3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3173A6NAS3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3173A6NAS3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3173A6NAS3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3173A6NAS3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3173A6NAS3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3173A6NAS3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3173A6NAS3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3173A6NAS3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3173A6NAS3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3173A6NAS3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm3173A6NAS3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm3173A6NAS3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm3173A6NAS3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3173A6NAS3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3173A6NAS3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3173A6NAS3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3173A6NAS3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3173A6NAS3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3173A6NAS3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3173A6NAS3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3173A6NAS3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3173A6NAS3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3173A6NAS3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3173A6NAS3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3173A6NAS3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3173A6NAS3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3173A6NAS3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3173A6NAS3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3173A6NAS3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3173A6NAS3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3173A6NAS3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3173A6NAS3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3173A6NAS3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3173A6NAS3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3173A6NAS3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3173A6NAS3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3173A6NAS3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3173A6NAS3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3173A6NAS3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3173A6NAS3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3173A6NAS3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3173A6NAS3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3173A6NAS3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3173A6NAS3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3173A6NAS3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3173A6NAS3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3173A6NAS3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3173A6NAS3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3173A6NAS3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3173A6NAS3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3173A6NAS3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3173A6NAS3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3173A6NAS3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3173A6NAS3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3173A6NAS3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3173A6NAS3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3173A6NAS3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3173A6NAS3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3173A6NAS3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3173A6NAS3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3173A6NAS3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3173A6NAS3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3173A6NAS3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3173A6NAS3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms