Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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