Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms