Protein–RNA interactions for Protein: A2AEN9

Gm5938, Predicted gene 5938, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5938A2AEN9 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5938A2AEN9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5938A2AEN9 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5938A2AEN9 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5938A2AEN9 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5938A2AEN9 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5938A2AEN9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5938A2AEN9 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5938A2AEN9 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5938A2AEN9 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5938A2AEN9 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5938A2AEN9 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5938A2AEN9 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5938A2AEN9 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5938A2AEN9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5938A2AEN9 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5938A2AEN9 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5938A2AEN9 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5938A2AEN9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5938A2AEN9 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5938A2AEN9 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5938A2AEN9 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5938A2AEN9 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5938A2AEN9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5938A2AEN9 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5938A2AEN9 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5938A2AEN9 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5938A2AEN9 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5938A2AEN9 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5938A2AEN9 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5938A2AEN9 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5938A2AEN9 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5938A2AEN9 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5938A2AEN9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5938A2AEN9 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5938A2AEN9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5938A2AEN9 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5938A2AEN9 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5938A2AEN9 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5938A2AEN9 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5938A2AEN9 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5938A2AEN9 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5938A2AEN9 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5938A2AEN9 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5938A2AEN9 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5938A2AEN9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5938A2AEN9 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5938A2AEN9 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5938A2AEN9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5938A2AEN9 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5938A2AEN9 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5938A2AEN9 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm5938A2AEN9 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm5938A2AEN9 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm5938A2AEN9 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm5938A2AEN9 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm5938A2AEN9 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm5938A2AEN9 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm5938A2AEN9 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm5938A2AEN9 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm5938A2AEN9 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm5938A2AEN9 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 235.4 ms