Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Pramef6A2A8M8 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Pramef6A2A8M8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Pramef6A2A8M8 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Pramef6A2A8M8 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Pramef6A2A8M8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Pramef6A2A8M8 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Pramef6A2A8M8 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Pramef6A2A8M8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Pramef6A2A8M8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Pramef6A2A8M8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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