Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Calcoco2A2A6M5 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Calcoco2A2A6M5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Calcoco2A2A6M5 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Calcoco2A2A6M5 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Calcoco2A2A6M5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Calcoco2A2A6M5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Calcoco2A2A6M5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Calcoco2A2A6M5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Calcoco2A2A6M5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Calcoco2A2A6M5 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Calcoco2A2A6M5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Calcoco2A2A6M5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Calcoco2A2A6M5 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Calcoco2A2A6M5 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Calcoco2A2A6M5 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Calcoco2A2A6M5 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Calcoco2A2A6M5 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Calcoco2A2A6M5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Calcoco2A2A6M5 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Calcoco2A2A6M5 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Calcoco2A2A6M5 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Calcoco2A2A6M5 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Calcoco2A2A6M5 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms