Protein–RNA interactions for Protein: A2A6H3

Fbxo47, F-box only protein 47, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo47A2A6H3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fbxo47A2A6H3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fbxo47A2A6H3 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fbxo47A2A6H3 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fbxo47A2A6H3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fbxo47A2A6H3 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fbxo47A2A6H3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fbxo47A2A6H3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fbxo47A2A6H3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fbxo47A2A6H3 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fbxo47A2A6H3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fbxo47A2A6H3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fbxo47A2A6H3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fbxo47A2A6H3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fbxo47A2A6H3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fbxo47A2A6H3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fbxo47A2A6H3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fbxo47A2A6H3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fbxo47A2A6H3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fbxo47A2A6H3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fbxo47A2A6H3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fbxo47A2A6H3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fbxo47A2A6H3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fbxo47A2A6H3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fbxo47A2A6H3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fbxo47A2A6H3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fbxo47A2A6H3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fbxo47A2A6H3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fbxo47A2A6H3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fbxo47A2A6H3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fbxo47A2A6H3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fbxo47A2A6H3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fbxo47A2A6H3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fbxo47A2A6H3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fbxo47A2A6H3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fbxo47A2A6H3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fbxo47A2A6H3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fbxo47A2A6H3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fbxo47A2A6H3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fbxo47A2A6H3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fbxo47A2A6H3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fbxo47A2A6H3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fbxo47A2A6H3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fbxo47A2A6H3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fbxo47A2A6H3 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fbxo47A2A6H3 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Fbxo47A2A6H3 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fbxo47A2A6H3 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fbxo47A2A6H3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fbxo47A2A6H3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fbxo47A2A6H3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fbxo47A2A6H3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fbxo47A2A6H3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fbxo47A2A6H3 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fbxo47A2A6H3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fbxo47A2A6H3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fbxo47A2A6H3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fbxo47A2A6H3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fbxo47A2A6H3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fbxo47A2A6H3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fbxo47A2A6H3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Fbxo47A2A6H3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fbxo47A2A6H3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fbxo47A2A6H3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fbxo47A2A6H3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fbxo47A2A6H3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fbxo47A2A6H3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fbxo47A2A6H3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fbxo47A2A6H3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fbxo47A2A6H3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Fbxo47A2A6H3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fbxo47A2A6H3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fbxo47A2A6H3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fbxo47A2A6H3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fbxo47A2A6H3 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Fbxo47A2A6H3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fbxo47A2A6H3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fbxo47A2A6H3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fbxo47A2A6H3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fbxo47A2A6H3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fbxo47A2A6H3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fbxo47A2A6H3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Fbxo47A2A6H3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
Fbxo47A2A6H3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Fbxo47A2A6H3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms