Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GSI2

1700018G05Rik, RIKEN cDNA 1700018G05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms