Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP08

1700028J19Rik, RIKEN cDNA 1700028J19 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms