Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YTW6

Scn2a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn2aA0A0J9YTW6 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Scn2aA0A0J9YTW6 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scn2aA0A0J9YTW6 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Scn2aA0A0J9YTW6 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scn2aA0A0J9YTW6 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scn2aA0A0J9YTW6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scn2aA0A0J9YTW6 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scn2aA0A0J9YTW6 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scn2aA0A0J9YTW6 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Scn2aA0A0J9YTW6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scn2aA0A0J9YTW6 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scn2aA0A0J9YTW6 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scn2aA0A0J9YTW6 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn2aA0A0J9YTW6 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn2aA0A0J9YTW6 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scn2aA0A0J9YTW6 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn2aA0A0J9YTW6 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn2aA0A0J9YTW6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn2aA0A0J9YTW6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms