Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P5

Trbv26, T cell receptor beta, variable 26 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv26A0A0B4J1P5 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Trbv26A0A0B4J1P5 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Trbv26A0A0B4J1P5 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Trbv26A0A0B4J1P5 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Trbv26A0A0B4J1P5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Trbv26A0A0B4J1P5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Trbv26A0A0B4J1P5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Trbv26A0A0B4J1P5 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Trbv26A0A0B4J1P5 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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