Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H1

Trbv12-2, T cell receptor beta, variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 124 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv12-2A0A0B4J1H1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trbv12-2A0A0B4J1H1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trbv12-2A0A0B4J1H1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trbv12-2A0A0B4J1H1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trbv12-2A0A0B4J1H1 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trbv12-2A0A0B4J1H1 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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