Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 AC022146.1-201ENST00000595307 847 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 DNAJC10-208ENST00000537515 1669 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 DEFB129-201ENST00000246105 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 RPL7P1-201ENST00000468161 747 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 RPL7P9-201ENST00000468715 747 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 AC004069.2-201ENST00000505438 1114 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 AC107982.3-201ENST00000584957 985 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 FBXO8-205ENST00000615392 1591 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 AL354977.2-201ENST00000430387 728 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 Z74696.2-201ENST00000436514 498 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 TPMTP4-201ENST00000450749 678 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 AC123023.1-201ENST00000455974 555 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 TRBV8-2-201ENST00000475637 270 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 AC146944.2-203ENST00000502493 354 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 AC109458.1-201ENST00000508858 316 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 AC022929.1-201ENST00000560675 823 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 AC027104.1-201ENST00000563702 681 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms