Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 BTK-209ENST00000618050 2417 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01699-201ENST00000319701 259 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 ODF3-202ENST00000342593 386 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 TINAG-202ENST00000370864 692 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 TINAG-203ENST00000370869 782 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 CD52-201ENST00000374213 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 AC099782.1-201ENST00000425889 474 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 COX4I1P2-201ENST00000447446 547 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 ZFPM2-AS1-201ENST00000509144 542 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SKP70-201ENST00000516655 271 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 TRIM77BP-201ENST00000524985 1119 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 AC079793.1-201ENST00000553076 713 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 AL049836.2-201ENST00000553318 513 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 AC013565.1-201ENST00000565938 597 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 TTN-AS1-226ENST00000588716 604 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 DAOA-AS1-201ENST00000448407 2482 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 TLR10-207ENST00000613579 3801 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 CRYBA1-201ENST00000225387 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 RPL21P50-201ENST00000417698 477 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 SNX18P26-201ENST00000458433 740 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 GM2AP2-201ENST00000491764 562 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 AP001207.3-201ENST00000520268 491 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 AL133399.1-201ENST00000527476 298 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 FGF1-213ENST00000610990 3802 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 CYP3A5-201ENST00000222982 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF211-205ENST00000391703 2239 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
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