Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AC138305.2-201ENST00000561595 556 ntTSL 4 BASIC1.64□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AC022166.1-201ENST00000567851 581 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 HAUS1-203ENST00000585518 506 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 OR7A8P-201ENST00000595427 913 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 PRDX3P4-201ENST00000470828 747 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 HNRNPKP5-201ENST00000515300 253 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AC063952.1-203ENST00000634410 658 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC1.63□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AL354977.2-201ENST00000430387 728 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AC016526.2-201ENST00000554225 520 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AC012355.1-201ENST00000450290 769 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AC106028.2-201ENST00000555325 464 ntTSL 4 BASIC1.63□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC1.63□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 MTND4P26-201ENST00000415971 1359 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 PDE1C-203ENST00000396184 8852 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 DISC1FP1-201ENST00000561596 545 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC1.62□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 SLC1A2-202ENST00000395750 11538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 RPL5P30-201ENST00000465511 891 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AC015911.5-201ENST00000587076 451 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
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